問題を発見したので、追記します。
追記：wp-content/blogs.phpを削除した上で、mod_rewriteの設定を書き換えます。
.htaccess リライトルールの変更
RewriteRule ^(.*/)?files/(.*) wp-content/blogs.php?file=$2 [L]
↓
RewriteRule ^(.*/)?files/(.*) wp-includes/ms-files.php?file=$2 [L]
画像が表示されなくなるので、.htaccessを変更
wordPressは、3.0で従来シングル版と、派生版のMU（マルチユーザ）が統合されました。
wordPressMU 2.9.2からアップデート作業を行いましたが現在のところ、不都合を見つけられないです。
自動アップデートを行いました。
wp-config.php
define( 'NONCE_SALT','honyarara');
の追記を求められます。
次に、wp-content/blogs.php を削除します。
wp-includes/にms-接頭辞のついた8ファイルが、マルチユーザタイプ用のファイルなのかもしれません。
MU版では、シングルユーザ版のように、
define('WP_ALLOW_MULTISITE', true);
define( 'MULTISITE', true );
といった定数の追加を求められることはありませんでした。
このまま、Update Network をクリックして、all Done で終了です。
シングル版のアップデートよりも簡単そうです。
アップデート後の動作確認は、これからです
2.9.2には、default テーマを置いていました。デフォルトテーマが存在する場合には、デフォルトを使うことができます。
ただ、twenty tenを使った場合には、デフォルトのfunctions.phpは、読み込んでいない模様です。従来のデフォルトと新しいデフォルトのtwenty tenのヒエラルキについては、チェックしておいたほうがよさそうです。
text2htmlプラグイン、テーマファイル等、当サイトで制作した関連する拡張は、正常に動作していると考えています。